Die Idee zu dieser CD-Reihe entstand im Jahre 2007 anlässlich des 40-jährigen Bestehens der Flentrop-Orgel in St. Marien. Für die Reihe „Mit Bach durchs Jahr“ sind insgesamt sechs CDs geplant. Jede der CD-Einspielungen wird von einem der großen Präludien und Fugen Bachs umrahmt, das charakterlich und tonartlich zu den Chorälen der betreffenden Kirchenjahreszeit passend ausgewählt wurde. Die Choräle entstammen den verschiedenen großen Choralsammlungen Johann Sebastian Bachs: dem „Orgelbüchlein“, den „Achtzehn Leipziger Chorälen“, der Kirnbergerschen Sammlung und den „Schübler-Chorälen“. Auch einzeln überlieferte Orgelchoräle sind vertreten. In der Mitte der Programmauswahl steht jeweils eine der sechs Sonaten für die Orgel, auch Triosonaten genannt. Carsten Zündorf erklärt seine Motivation zur CD-Reihe: „Diese Einspielung soll dazu beitragen, dass die Texte und Melodien im Lauf des Kirchenjahres hörend nachvollzogen werden können.“ Bereits erschienen sind die CDs „Advent“ (CD1) sowie „Weihnachten und Epiphanias“ (CD2). Geplant sind weitere drei CDs zu den Kirchenjahren: „Ostern und Himmelfahrt“ (CD4), „Pfingsten und Trinitatis“ (CD5) und „Ende des Kirchenjahres“ (CD6).